Gruppen | AK Gräter

Unsere Forschungsgruppe widmet sich der Weiterentwicklung von Machine-Learning Methoden und Modellen, um molekulare Eigenschaften vorherzusagen und chemische Reaktionen präzise und effizient zu simulieren. Wir entwickeln Modelle, die ein breites Spektrum an Systemen abdecken, einschließlich reaktiver Prozesse und biologischer Moleküle. [mehr]

Unser Ziel ist es, die Mechanismen zu entschlüsseln, durch die Makro-Biomoleküle miteinander interagieren, um ihre Funktionen auszuführen, als Reaktion auf äußere Einflüsse. Um dieses Ziel zu erreichen, führen wir Computersimulationen auf verschiedenen Auflösungsstufen und mit unterschiedlicher Komplexität durch. [mehr]

Meine Gruppe erforscht Redox- und freie Radikalreaktionen von Biomolekülen in vitro und in lebenden Zellen. 
Unser Ziel ist es, zelluläre Redox- und Radikalkontrollmechanismen zu verstehen. Derzeit untersuchen wir die Rolle von Poly-Schwefel als Grundlage für zelluläre Redox- und Radikalkontrollmechanismen. [mehr]

Unsere Gruppe erforscht wie Proteine mechanischen Stress über evolutionäre Zeitskalen hinweg kodieren und darauf reagieren. Durch die Verknüpfung von Mechanik, Chemie und Evolution möchten wir neue Einblicke in Gewebemechaniken und Alterung gewinnen und gleichzeitig die Entwicklung von biomimetic protein materials inspirieren.
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Hauptziel der Forschungen war und ist einerseits die Entwicklung von innovativen
Simulationsalgorithmen (namentlich Lattice Boltzmann / Molekulardynamik
Hybridverfahren) und andererseits deren Anwendung auf Probleme der Dynamik
weicher Materie, mit Schwerpunkt auf hydrodynamischen Wechselwirkungen. [mehr]

In unserer Gruppe konzentrieren wir uns auf wissenschaftliches Rechnen, HPC-Infrastruktur und Softwareentwicklung. Zu unseren Aufgaben gehören die Pflege und Weiterentwicklung zentraler Simulationssoftwarepakete wie ESPResSo++ (Kremer-Gruppe), GROMACS_FDA und KIMMDY (BMM-Gruppe). Zudem stellen wir HPC-Resourcen für Simulationen zur Verfügung und unterhalten die Cloud-Infrastruktur für das Forschungsdatenmanagement (FDM) am MPIP.
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